東莞市軌道交通有限公司于2009年5月25日開始運作，7月21日完成工商注冊，8月27日揭牌，是按照現(xiàn)代企業(yè)制度管理的法人獨資公司，實行“小業(yè)主，大社會”和“一體化”的管理模式。公司經營范圍包括：城市軌道交通項目的建設、維護、經營、開發(fā)和綜合利用；投資興辦實業(yè)；商業(yè)批發(fā)、零售；自有物業(yè)管理；城市軌道交通相關業(yè)務咨詢；房地產開發(fā)經營。

公司目前負責建設的東莞市軌道交通R2線首期工程總長37.8公里,共設車站15座、車輛段1座、控制中心1座、主變電所2座，總投資概算為180.12億元，計劃于2015年開通運營。

公司還承擔東莞市軌道交通建設規(guī)劃所包含的其他線路以及現(xiàn)代有軌電車項目的建設與運營等工作。